最初の聖心女子学院は1801年にフランスのアミアンで創立されました。
200年を経た現在、同じ精神を受け継いだ姉妹校は世界31カ国に広がり、その数は148校となっています。

日本では1908年に4名の聖心会修道女がオーストラリアから来日し、最初の聖心女子学院が東京に、そして1923年には神戸に住吉聖心女子学院（高等女学校、小学校）が設立されました。1926年には校舎が現在の小林へ移転され、校名が小林聖心女子学院と改称されました。
現在、日本における聖心女子学院は、上記2校のほか、聖心女子大学、聖心女子専門学校、不二聖心女子学院、札幌聖心女子学院、聖心インターナショナルスクールの7校の姉妹校があります。

小林聖心女子学院は1947年に専門学校を設置しました。翌1948年には学制改革に伴って、中学校と高等学校が発足し、1949年には聖心女子大学小林分校が開校しました。その後1966年に聖心女子大学小林分校は東京本校に併合されました。
高等学校では、1985年からのフィリピン体験学習、1990年からの週5日制実施、教科として体験学習科の導入など、教育内容を充実させるためのカリキュラム編成にいち早く取り組んでいます。